Microflore normale du corps humain et ses fonctions

La microflore pariétale de l'intestin colonise la membrane muqueuse sous forme de microcolonies, formant un film biologique particulier constitué de corps microbiens et d'une matrice d'exopoly-saccharide. Les exopolysaccharides de micro-organismes, appelés glycocalyx, protègent les cellules microbiennes de toute une gamme d'effets physico-chimiques et biologiques. La muqueuse intestinale est également protégée par un film biologique.

La fonction la plus importante de la microflore intestinale normale est sa participation à la résistance à la colonisation, entendue comme une combinaison de facteurs de protection du corps et de caractéristiques compétitives, antagonistes et autres des anaérobies intestinales, donnant la stabilité de la microflore et de microorganismes étrangers empêchant la colonisation des muqueuses.

La microflore vaginale normale comprend les bactéroïdes, les lactobacilles, les peptostreptokokki et les clostridia.

Les représentants de la microflore normale, tout en réduisant la résistance du corps, peuvent provoquer des processus inflammatoires purulents, c.-à-d. la microflore normale peut être une source d’auto-infection, ou d’infection endogène. C'est également une source de gènes, tels que les gènes de résistance aux antibiotiques.

La microflore pariétale est

Une variété de maladies intestinales inflammatoires non infectieuses et de troubles «fonctionnels» (syndrome du côlon irritable) s'accompagnent souvent de modifications de l'homéostasie microécologique. Au stade actuel de développement de la gastro-entérologie domestique, le problème de la dysbiocénose intestinale est évalué selon de nouvelles perspectives (Sheptulin AA, 1999).

De nombreux articles de discussion sont consacrés à ce numéro sur le rôle de la microflore intestinale dans le fonctionnement normal du corps, ainsi que sur les aspects microbiologiques du diagnostic des troubles de la biocénose (B. Shenderov, 1998, V. Bondarenko, 1998, V. G. Rumyantsev, G.999, Korneva T.K., 1999, Z. Zimmerman, 2000)

La microflore intestinale est fonctionnellement divisée en deux groupes principaux: pariétal et luminal. La microflore éclairée ou transitoire fait partie de la microflore fécale. Ses principaux représentants sont des microorganismes aérobies et éventuellement aérobies, principalement des membres de la famille des Enterobacteriaceae.

La composition de la microflore luminale n'est pas constante et varie en fonction de la nature de la nutrition, de la qualité des aliments, de l'état fonctionnel de l'intestin, de la fréquence des selles. À cet égard, l'examen bactériologique de la microflore fécale par la méthode standard (recommandations méthodiques du ministère de la Santé de l'URSS n ° 10-11 / 31 du 04.14.1986 g) est l'étude de la partie du spectre bactérien qui n'existe plus ou qui ne le sera plus dans un proche avenir.

Cette dernière circonstance est de la plus haute importance pour interpréter les résultats d'un ensemencement bactériologique de matières fécales dans les maladies dites "fonctionnelles" de l'intestin. En particulier, dans le syndrome du côlon irritable avec diarrhée, il existe un "lessivage" constant de la microflore luminale et il est difficile de juger de manière fiable de la constance de cette dernière et, partant, des effets pathologiques sur la muqueuse.

La microflore pariétale est à 99% représentée par des bactéries anaérobies et éventuellement anaérobies sporifères (bifidobactéries et lactobacilles, bactéroïdes, streptocoques de l’acide lactique, etc.). La flore pariétale est "fixée". Des représentants de la microflore normale sont fixés aux récepteurs de surface des cellules épithéliales. Il est plus stable, c’est un système stable, qui est assez difficile à détruire.

Considérant le fait que la colonisation des populations saprophytes dans le côlon est différente même dans des conditions normales (Michelsaar ME, 1990), la microflore transitoire domine dans le contenu fécal, ainsi que les difficultés d’évaluation bactériologique du spectre de la microflore intestinale pariétale. coénose microbienne uniquement par l'examen bactériologique des matières fécales.

À cet égard, il est important d'évaluer précisément la microflore pariétale du côlon. Cela peut être fait à la fois bactériologiquement en semant des colobioptans sur des milieux nutritifs et en histobactérioscopie par microscopie optique de préparations colorées par une technique spéciale.

La méthode histobactérioscopique a été largement utilisée dans les travaux de A.V. Zinserling et son école étudient les maladies infectieuses. La détection des microorganismes peut être effectuée à la fois dans des frottis et dans des coupes histologiques. Leur nombre ainsi que la structure des cellules tissulaires peuvent être détectés à l'aide de différentes méthodes de coloration (Zinserling AV, 1993).

Les problèmes posés par cette méthode de recherche sont liés à des problèmes purement techniques: le lavage de la couche superficielle de mucus contenant des microorganismes pendant le traitement du matériel de biopsie, de sorte que l’évaluation de la microflore devient impossible ou inutile.

Des méthodes de fixation, permettant la stabilisation de la couche de paroi du mucus de biopsie, ont été développées pour le diagnostic de Helicobacter pylori (Morozov IA, 1997, 1999). Une méthode de recouvrement de la surface de la biopsie avec une couche de gel d'agar est proposée afin d'éviter le délavage du mucus pariétal lors de l'affichage du matériel afin d'évaluer le degré de contamination et le lien entre les bactéries et la surface de la muqueuse gastrique.

Cette technique est utilisée pour préserver le mucus supraépithélial chez les colonobioptats. La pré-immersion d'un morceau de membrane muqueuse dans un gel d'agar à 1% chauffé dans un four à micro-ondes, préparé sur un tampon de phosphate stérile à pH 7,2-7,4, vous permet de fixer le mucus contenant des micro-organismes et de le conserver en affichant et en colorant davantage la biopsie. La couche de gel d'agar crée, dans une certaine mesure, des conditions anaérobies pour les micro-organismes lors de la livraison du matériel au laboratoire bactériologique.

Pour l'inoculation bactériologique, un fragment de muqueuse colique biopté homogénéisé dans 0,1 ml de solution de chlorure de sodium isotonique a été utilisé. Lors de la première étape de l’étude, il était prévu d’évaluer uniquement la composition de la population aérobie de micro-organismes. La comptabilisation a été effectuée en unités formant colonie (UFC) sur un milieu nutritif solide en termes de 1 ml de substrat, suivie de l'identification biochimique et sérologique de représentants de la famille des Enterobacteriaceae et d'autres bactéries pathogènes sous condition.

En menant une étude histobactérioscopique, le nombre de microorganismes dans le mucus pariétal de la colobiopsie a été évalué par une méthode semi-quantitative par analogie avec la détermination du degré de contamination de H. pylori en gastrobiopsie. un faible degré de dissémination - jusqu'à 20 corps microbiens, une moyenne de 20 à 50 corps microbiens, un puissant - plus de 50 corps microbiens dans le champ de vision avec une augmentation de x900 (immersion dans l'huile).

Les colonobioptates de patients présentant un diagnostic de syndrome du côlon irritable, chez lesquels une coloscopie et une biopsie ont été réalisées pour exclure un processus tumoral, une maladie intestinale inflammatoire, etc., ont été choisis comme modèle pour l'étude de la microflore pariétale du côlon, sans modification structurelle prononcée de la coloscopie. Ces objets peuvent être considérés comme une norme conditionnelle (membrane muqueuse inchangée).

70 patients âgés de 15 à 50 ans ont été examinés. 210 colobioptates obtenus par fibrocolonoscopie à partir du côlon aveugle, transverse et du côlon sigmoïde ont été étudiés. Dans 30 échantillons de biopsie, la couche de mucus pariétal semblait être un desquami. Dans le même temps, l'image histobactérioscopique n'a pas été vérifiée. Dans 180 préparations, la couche de mucus pariétal était préservée, ce qui permettait de les soumettre à un examen histobactérioscopique.

Dans les échantillons de biopsie de la membrane muqueuse du caecum (51 échantillons) dans l'étude de la méthode histobactérioscopique, un degré élevé de contamination a été trouvé dans 28 cas. La flore était représentée par des bâtonnets fins à Gram positif, disposés en chaînes courtes ou parallèles (vraisemblablement des lactobacilles) et d'apparence pléomorphe (vraisemblablement des bifidobactéries).

Des bâtonnets pléomorphes à Gram négatif (probablement des bactéroïdes) ont été observés dans des proportions presque égales avec les représentants à Gram positif des microorganismes. Des petits cocci à Gram positif localisés séparément ont été détectés en petite quantité. Parallèlement, il existait un faible degré de dissémination avec de petits bâtons droits à Gram négatif, situés séparément ou par paires (vraisemblablement des microorganismes de la famille des entérobactéries).

Dans 20 échantillons, les bâtonnets à Gram positif et à Gram négatif décrits ci-dessus, morphologiquement similaires aux lacto et bifidobactéries et aux bactéroïdes, ont été déterminés en quantités modérées et des bâtonnets à Gram négatif, morphologiquement similaires aux entérobactéries, ont également été notés en petite quantité. Seulement dans 4 cas, les bacilles à Gram négatif de la famille des entérobactéries ont provoqué un fort degré d'insémination avec un faible degré de colonisation de la membrane muqueuse par des représentants de la microflore normale.

Un ensemencement bactériologique du spécimen de biopsie cæcale a montré une augmentation des souches entières de E. coli. Dans 9 échantillons de biopsie, E. coli a été semé avec une activité enzymatique réduite et 4 E. coli ayant une capacité hémolytique. Dans un cas, la détoxication de la culture de Klebsiella a été identifiée.

L'étude histobactérioscopique d'échantillons de biopsie de la membrane muqueuse du côlon transverse a permis d'établir un degré élevé de dissémination par des bâtonnets à Gram positif et négatif (des représentants de la microflore normale) dans 16 cas. Dans le même temps, des représentants de la famille des entérobactéries ont provoqué un faible degré de colonisation.

Dans la plupart des cas (42 colobioptats), on a observé des quantités modérées de bactéries morphologiquement similaires à des microorganismes de microflore normale, et des représentants d'entérobactéries et de cocci de petite taille à Gram positif dans de petites chaînes (entérocoques) étaient présents dans des proportions égales.

Un degré élevé de dissémination de petites barres droites gram-négatives avec un petit nombre de coques gram-positifs, situés à la fois dans les chaînes (entérocoques) et les grappes (staphylocoques), a été observé chez 6 colonobioptats. Les saprophytes présents dans ces échantillons de biopsie n'étaient présents qu'en petites quantités.

Sur le plan bactériologique, les représentants d'Escherichia coli normaux ont été semés principalement. Parallèlement, dans 10 cas, E. coli a été identifié avec des propriétés enzymatiques réduites, ainsi que des souches hémolytiques. Dans 7 cas, des représentants de la microflore conditionnellement pathogène (Klebsiella, Citrobacter, Staphylococcus aureus) ont été semés.

Dans la paroi d'échantillons de biopsie de mucus rapport sigmoïde de micro-organismes est la suivante: à partir de 65 biopsies du haut degré de contamination de la microflore normale avec une a été observée à faible degré de colonisation par des micro-organismes de la famille Enterobacteriaceae dans 15 cas, le degré modéré de contamination de bâtonnets Gram-positives avec une petite quantité de bactéries Gram-négatives et cocci Gram-positif 32 biopsies en Dans 18 échantillons, les membres de la famille des entérobactéries ont prévalu sur les microorganismes anaérobies.

Leur nombre a été estimé en termes de degré de dissémination élevé et faible, respectivement. Parallèlement à cela, dans 13 échantillons de biopsie, il y avait un grand nombre de staphylocoques à Gram positif et dans 2 cas, des cellules fongiques ressemblant à des levures ont été observées. Dans les cultures bactériologiques, des baguettes à activité enzymatique réduite, des souches hémolytiques et des représentants d’Escherichia coli normaux étaient présents en proportions égales. Une microflore conditionnellement pathogène a été semée dans 13 cas.

Lors de l'examen bactériologique parallèle de la microflore fécale par la méthode standard chez 43 personnes, l'état de la microbiocénose intestinale était considéré comme une dysbactériose à 2-4 degrés. Cependant, au cours de l'examen histobactérioscopique, seuls 18 patients ont montré des violations de la composition de la microflore pariétale, qui consistaient à réduire le nombre de représentants d'une microflore normale et à coloniser la couche de mucus pariétale principalement par des bactéries pathogènes.

Une étude bactériologique sur le colobioptate ne présente pas les mêmes aspects négatifs que l'étude sur les matières fécales, bien que dans une moindre mesure. Les principales difficultés méthodologiques comprennent l’absence de méthodes sélectives d’isolement et de culture anaérobie de bactéries anaérobies non analysables. Par exemple, dans le gros intestin, le nombre de bactéries anaérobies non cultivées est compris entre 10 et 10 degrés - 10 à 11 degrés mt pour 1 g de contenu (Shenderov BA, 1998).

Le deuxième point négatif est l’absence de recommandations développées pour l’évaluation quantitative des micro-organismes cultivés. Les normes ne sont pas calculées. Cependant, malgré ces difficultés, l'ensemencement bactériologique d'un colonobioptate avec une couche de mucus natif, colonisée par la microflore pariétale et saprophyte, semble être une étude plus représentative en termes d'évaluation de l'état de la microbiocénose du côlon que de l'ensemencement des matières fécales avec une évaluation de la microflore transitoire.

La microflore intestinale s'est développée au cours de l'évolution humaine, elle est le résultat de diverses adaptations, adaptation du microorganisme à l'habitat du macroorganisme (VN Krasnogolovets, 1989).

Le principal processus énergétique du groupe de micro-organismes anaérobies de la flore proche du mur est le mécanisme le plus ancien de l'évolution, à savoir la fermentation qui se produit sans oxygène. La matière organique est le donneur et l'accepteur d'électrons. L'oxygène pour ces bactéries est toxique ou indifférent. La structure de la muqueuse intestinale avec ses villosités, ses cryptes, une couche de mucus produite par les cellules caliciformes, est un endroit idéal pour créer des conditions d'anaérobiose.

La microflore normale, colonisant la muqueuse intestinale, est évolutive plus ancienne et occupe sa niche. L’une des fonctions principales de la microflore pariétale est d’assurer la résistance à la colonisation due à l’expression de diverses substances antagonistes, actives, de type antibiotique, acides organiques, peroxyde d’hydrogène, lysozyme, colicines, bloqueurs de récepteurs, etc., empêchant l’adhésion de microorganismes pathogènes et pathogènes conditionnels aux entérocytes.

On connaît également une autre fonction importante de la microflore saprophyte - immunomodulateur associé à des bactéries Gram-positives produire dipeptide muramyle, ce qui a un effet stimulant sur les phagocytes, et avec l'influence du O-antigène de bactéries gram-négatives sur la synthèse de cellules immunitaires sécrétant des immunoglobulines, des cytokines et de l'interféron (A. Bondarenko avec et al., 1998).

La glaire pariétale intestinale, les immunoglobulines sécrétoires et la flore saprophyte constituent ensemble une protection préépithéliale occupant les indentations et les élévations formées par les entérocytes. Les micro-organismes pathogènes accidentels qui pénètrent dans la lumière intestinale ou les bactéries pathogènes conditionnelles qui y vivent produisent une variété d’endotoxines et d’exotoxines.

La voie menant aux toxines vers leurs récepteurs spécifiques bloque la barrière muqueuse du biofilm. Dans des conditions favorables à la reproduction massive d'agents pathogènes, il existe une possibilité réelle que ceux-ci manifestent leurs propriétés pathogènes en raison de leur adhésion aux cellules épithéliales avec une colonisation ultérieure de la membrane muqueuse.

La phosphorylation par oxydation est la principale source d’énergie pour les microorganismes aérobies de la flore luminale. Le donneur d'électrons est constitué de composés organiques d'origine biologique, présents en quantité optimale dans la lumière de l'intestin.

Les facteurs environnementaux défavorables, les perturbations nutritionnelles, l'utilisation irrationnelle d'antibiotiques, l'hormonothérapie et d'autres effets négatifs, qui affaiblissent la résistance spécifique et non spécifique du macroorganisme, contribuent à la formation d'un processus inflammatoire chronique et d'une dysbactériose concomitante dans le tractus gastro-intestinal.

Ayant la possibilité d'entrer en contact avec l'entérocyte (colonocyte) dans des lieux de "percée", le microorganisme pathogène déclenche la sécrétion de type 3 (dépendant du contact) - le principal mécanisme moléculaire de survie et de reproduction dans l'organisme hôte, commun à diverses bactéries (Musser J M, 1996). Ce mécanisme est responsable du transport des molécules effectrices du cytoplasme à la surface des bactéries, où, au contact, elles provoquent la modification des protéines cellulaires. De telles molécules effectrices ont été trouvées dans Yersinia, S flexneri, E. coli (Ryapis LA, Lipnitsky AV, 1998).

Lorsque la couche de mucus contenant des IgA est endommagée, la dégranulation des cellules du gobelet se produit avec la destruction de la flore saprophyte (Droy M.T 1985). C’est ainsi que le biofilm issu de la microflore normale est remplacé par un biofilm de microorganismes pathogènes ou pathogènes. Dans certaines conditions, les bactéries pathogènes sous condition peuvent devenir plus compétitives pour les sites d’adhésion que les bifidobactéries et les lactobacilles et, étant donné que leurs connexions avec les cellules sont extrêmement fortes, il devient possible de former une source d’infection endogène.

Ainsi, l’utilisation de la méthode de recherche histobactérioscopique, associée à l’évaluation morphologique de la biopsie du colvnio, permet d’évaluer la composition de la microflore de la paroi, ce qui donne une image objective de l’état de la microbiocénose, car c’est dans cette zone que le microorganisme entre en contact avec le lieu de la colonie. Cette méthode, associée à l'inoculation bactériologique de matériel de biopsie, peut être utilisée pour une caractéristique indicative de la composition qualitative de la microflore pariétale du gros intestin lors d'examens cliniques et de laboratoires complexes de patients présentant un dysfonctionnement intestinal.

Littérature

1. Bondarenko A.V., Bondarenko V.M., Bondarenko V.M. Moyens d'améliorer le traitement étiopathogénétique de la dysbactériose. // Journal mikrobiol. -1998. - № 5. - P. 96 -101.

2. Dysbactérioses du tractus gastro-intestinal / V.M. Bondarenko, B.V. Boev, E.A. Lykov et al., // Ros, Zh. gastro-entérol., hépatol, coloproct. -1998. - N ° 1.-C.61 - 63.

3. Koreneva TK: dysbactériose intestinale chez les patients proctologiques présentant des aspects microbiologiques. // Ros. Journal gastro-entérol, hépatol, col. - 1999. - № 3 -С. 55-60.

4. Krasnogalovets V.D. Dysbiose intestinale. - M.: Medicine, 1989. - 208 p.

5. Muselsaar M.E. Formation et préservation de la microflore résistante du tractus gastro-intestinal // Actes de VNIIA. - M., 1990. - Feu 19 - C 26

6. Morozov I.A. Aspects morphologiques de l'infection à HP dans l'estomac // Cinquième session du Groupe russe pour l'étude de Helicobacter pylori. Matériel de session. - Omsk, 1997. -C. 62 à 66. 7 Morozov I.A. Problèmes de diagnostic morphologique du pylône d'Helicobacter dans l'estomac. // Ros. journaux gastroentérol hépatol; Koloprokt - 1999 - №2. -C. 46 - 48.

8. L'utilisation de préparations biologiques bactériennes dans la pratique du traitement des patients atteints d'infections intestinales. Diagnostic et traitement de la dysbiose intestinale: méthode, recommandations / Ministère de la santé de l'URSS. - M, 1986 - 23 s

9. Rumyantsev V.G. Dysbactériose intestinale, signification clinique et principes de traitement. // Ros zhurn. gastro-entérol., hépatol, coloproct - 1999-N ° 3 C. 61 - 63.

10. Ryapis LA, Lipnitsky A. V. Aspects microbiologiques et génétiques de la pathogénie des bactéries // Journ mikrobiol -1998. - № 6. -1 109-113

11 Zinserling A.V. Infections modernes. Anatomie pathologique et problèmes de pathogenèse. Manuel. - SPb. Sothis - 1993 - 363s

12. Les "européanismes occidentaux" de Zimmerman Ya.S. et leur place dans la terminologie médicale russe moderne, autres problèmes terminologiques controversés // Klin. médecine - 2000 - №1 - С 59 - 62

13 Shenderov B.A. Microflore normale et son rôle dans le maintien de la santé humaine. // journal Ros. gastroentérol, hépatol, coloproct - 1998 - № 1. -C. 61-65.

14. Sheptulin A.A. Syndrome de prolifération bactérienne et "dysbiose intestinale": leur place dans la gastro-entérologie moderne. // Ros. Journal gastro-entérol., Hépatol, coloproct. - 1999. - № 3 - С 51 - 55

Microflore d'air

L'air en tant qu'habitat est moins favorable que le sol et l'eau - peu de nutriments, soleil, assèchement. La principale source de pollution atmosphérique par les micro-organismes est le sol, moins l'eau est. Les espèces dominent les cocci (y compris le sarcin), les spores, les champignons, les actinomycètes. La microflore d'espaces clos (qui s'accumule lorsqu'elle est libérée par les voies respiratoires d'une personne) revêt une importance particulière. De nombreuses infections respiratoires (grippe, coqueluche, diphtérie, rougeole, tuberculose, etc.) se propagent par des gouttelettes en suspension dans l'air (dues à la formation d'aérosols persistants).

La pureté de l'air microbiologique est d'une grande importance en milieu hospitalier (opérations spéciales et autres départements de chirurgie).

La microflore humaine et sa valeur

L'enfant se développe dans le corps de la mère dans des conditions normales et dans des conditions stériles. La formation d’un nouveau système écologique «l’organisme humain + la microflore qui l’habite» commence au moment de la naissance et a pour base la microflore de la mère et de son environnement (principalement l’air). En peu de temps, la peau et les muqueuses, en communication avec l'environnement extérieur, sont peuplées par divers microorganismes. Dans la formation de la microflore des nourrissons de la première année (principalement les bifidobactéries et les lactobacilles), l'alimentation naturelle (au sein) joue un rôle essentiel.

La microflore normale (c'est-à-dire dans un corps sain) est représentée de manière quantitative et qualitative sur différentes parties du corps (écotopes) différemment. Les raisons sont des conditions d'habitat inégales.

La microflore autochtone (c'est-à-dire inhérente à cette région) peut être divisée en résident (permanent) et en transitoire (non permanent). Sur les muqueuses, en particulier dans le tractus gastro-intestinal, des représentants de la microflore normale vivent sous la forme de deux formes - certaines sont situées dans la lumière (luminal), l’autre est enfermée dans une matrice pariétale muqueuse qui forme un biofilm (microflore pariétale). Elle est associée à la résistance à la colonisation de l’intestin - barrière naturelle pour protéger les intestins (et le corps dans son ensemble) des agents infectieux.

Microflore cutanée normale.

Les plus peuplés de micro-organismes sont des endroits protégés de la lumière et du séchage. La composition de la microflore est la plus constante dans la région des orifices des follicules pileux. Staphylococcus epidermidis et S.saprophyticus, des champignons du genre Candida, et plus rarement des dipteroïdes et des microcoques sont plus souvent détectés.

Microflore des voies respiratoires

Les muqueuses du larynx, de la trachée, des bronches et des alvéoles d'une personne en bonne santé ne contiennent pas de micro-organismes. La majeure partie de la microflore du roto et du nasopharynx est responsable du streptocoque verdissant, mais moins fréquemment des néisseries, des diphtéroïdes et des staphylocoques sont détectés.

Microflore du tractus génito-urinaire

La biocénose microbienne est faible, les parties supérieures sont généralement stériles. Les bâtons lactiques de Doderlein (lactobacilles) prédominent dans le vagin d'une femme en bonne santé, créant un pH acide qui inhibe la croissance des bactéries à Gram négatif, des staphylocoques et des dipteroïdes. Il y a un équilibre entre les lactobacilles d'un côté et les plantes de gardnerella et anaérobies de l'autre.

Microflore du tractus gastro-intestinal

Les bactéries les plus actives se déposent dans le tractus gastro-intestinal. Dans le même temps, la colonisation se fait clairement «par étages». Dans l'estomac présentant une réaction acide de l'environnement et des parties supérieures de l'intestin grêle, le nombre de micro-organismes ne dépasse pas 1 000 par ml, et on rencontre plus souvent des lactobacilles, des entérocoques, des levures, des bifidobactéries et E. coli.

La microflore du gros intestin est la plus stable et la plus diversifiée. C’est vraiment un réservoir de bactéries de tout l’organisme: plus de 250 espèces ont été découvertes, la biomasse totale de microbes peut atteindre 1,5 kg. Le groupe dominant dans la norme comprend indéniablement les bactéries anaérobies (bifidobactéries et bactéroïdes) - jusqu'à 99%. Allouer la microflore muqueuse (pariétale) et luminale. La microflore pariétale confère une résistance à la colonisation de l'intestin, qui joue un rôle important dans la prévention (normale) et le développement (avec pathologie) des maladies infectieuses exogènes et endogènes.

La microflore normale et en particulier la microflore du gros intestin a un effet significatif sur le corps. Ses fonctions principales:

  • - protecteurs (antagonisme envers les autres, y compris les microbes pathogènes);
  • - immunostimulant (les antigènes de microorganismes stimulent le développement du tissu lymphoïde);
  • - digestif (principalement l'échange de cholestérol et d'acides biliaires);
  • - métaboliques (synthèse du groupe de vitamines B-B1,2,6,12, K, acides nicotiniques, pantothéniques, foliques).

Il existe différentes méthodes pour étudier le rôle d’une microflore normale. Les gnotobiontes (animaux sans germes) sont utilisés pour étudier le rôle des microorganismes dans le fonctionnement des systèmes physiologiques. Les technologies gnotobiologiques sont utilisées pour traiter le déficit immunitaire, les brûlures.

En raison de divers effets réduisant la résistance naturelle, les dysbactérioses se manifestent lors de maladies infectieuses et somatiques graves, en particulier lors de l'utilisation irrationnelle d'antibiotiques. Dysbactériose - modification de la composition quantitative et qualitative de la microflore, principalement de l'intestin. Plus souvent accompagnée par une augmentation de la microflore facultative anaérobie ou résiduelle (bacilles gram-négatifs - Escherichia coli, Proteus, pseudomonades), staphylocoques, champignons Candida. Ces micro-organismes sont généralement résistants aux antibiotiques et, lorsque la flore normale est supprimée par les antibiotiques et diminue la résistance naturelle, ils sont capables de se multiplier sans entrave.

Les formes les plus graves de dysbactériose sont la pneumonie à staphylocoques, la colite et la septicémie, la candidomycose, la colite pseudo-membraneuse, causée par Clostridium difficile.

La microflore pariétale est

Qu'est-ce qu'une microflore normale? D'un point de vue biologique général, cela signifie l'ensemble des biocénoses - en l'occurrence, les communautés microbiennes vivant dans les biotopes (Biotope ("lieu de vie")) - appliquées à la microécologie, il s'agit d'une partie de la membrane muqueuse, de la peau ou de l'organe d'un macroorganisme ayant le même type d'existence pour ses microorganismes (environ Ed. )) cavités ouvertes de l'hôte. Le "lieu de vie" optimal des micro-organismes peut servir de cavité buccale, de nasopharynx, d’œsophage, d’estomac, de gros et de gros intestin, d’urètre, etc. Un tel biotope, associé à une biocénose, forme un écosystème des voies respiratoires, gastro-intestinales ou urogénitales.
Selon la définition volumineuse de l'académicien de l'Académie des sciences médicales de Russie Anatoly Vorobiev (1923-2006), la microflore normale est un ratio qualitatif et quantitatif de diverses populations microbiennes d'organes et de systèmes individuels, préservant l'équilibre biochimique, métabolique et immunologique du corps, nécessaire au maintien de la santé humaine.

Il convient de noter que tous les microorganismes qui vivent dans un biotope particulier, entretiennent des relations symbiotiques complexes les uns avec les autres, sont reliés par des chaînes trophiques (alimentaires). Ainsi, les écosystèmes des muqueuses des cavités ouvertes et de la peau se forment à partir du moment de la naissance de l’enfant et se modifient au cours du processus de croissance et de développement. Succession, c'est-à-dire Les modifications consécutives dans d'autres zones de l'habitat de certaines biocénoses par d'autres aboutissent généralement à la formation d'une communauté microbienne stable et stable.

AMELIORATION DE LA MICROECOLOGIE: DISBACTERIOSE

10) régulés par un système de comportement collectif, appelé QS (Quorum Sensing). Un tel «sentiment de quorum» a été décrit pour la première fois dans l’étude du mécanisme de luminescence des bactéries marines. Il s’est avéré que des signaux de régulation transmis de cellule à cellule leur permettaient de coordonner leurs actions, transformant au moment opportun ces communautés apparemment élémentaires en un organisme multicellulaire de plusieurs millions d’exemplaires. Comme l'expliquait en détail le directeur de notre institut Alexander Gunzburg, académicien de l'Académie russe des sciences médicales, le type QS régit un large éventail de processus physiologiques, notamment la bioluminescence, la formation de biofilms, la synthèse de facteurs de pathogénicité et d'antibiotiques sécrétés, le transfert de plasmas conjugatifs et même la réplication. Oksana Rybalchenko a expliqué la formation de biofilms par des bactéries pathogènes sous condition et des champignons du genre Candida ressemblant à des levures avec croissance sur un milieu nutritif dense.
Dans la dysbactériose intestinale, des bactéries transitoires de la microflore peuvent pénétrer dans le cytoplasme des entérocytes, considérées comme une manifestation de l'endocytose - la capture de petites particules, de fluides et de macromolécules par la cellule du macroorganisme. À propos, parmi les bactéries pathogènes sous condition (Staphylococcus aureus, E. coli hémolytique, Klebsiella, etc.) et les champignons Candida, il existe des souches synthétisant des substances qui détruisent les lactobacilles, découvertes pour la première fois par des employés de l’Institut des produits hautement purs (St. Petersburg) et de l’épidémiologie et de la microbiologie. à eux. N.F. Gamaley.
Les manifestations cliniques de la dysbiose se caractérisent par des signes qui ne sont pas caractéristiques de la maladie principale. Le plus souvent, il y a une diminution de la résistance à la colonisation, une inhibition des fonctions du système immunitaire avec une augmentation de la sensibilité aux infections. La large propagation de ces pathologies, la plupart des auteurs nationaux considèrent à juste titre l'un des facteurs les plus importants déterminant l'augmentation actuelle de la fréquence et de la gravité des maladies aiguës et chroniques des voies digestive, respiratoire et urogénitale. (Photo: Endocytose de bactéries à Gram négatif dans la dysbiose intestinale - stades de capture des entérobactéries par une cellule eucaryote).

Microflore du corps humain

La microflore du corps humain est un ensemble de micro-organismes, de tous les biocénoses et de biotopes individuels du corps, établi de manière qualitative et quantitative relativement évolutive.

L’enfant est né stérile mais, malgré son passage dans le canal génital, il capture la microflore qui l’accompagne. La formation de la microflore résulte du contact du nouveau-né avec les micro-organismes présents dans l’environnement et de la microflore du corps de la mère. À l'âge de 1 à 3 mois, la microflore de l'enfant devient semblable à celle d'un adulte.

Le nombre de microorganismes d'un adulte est de 10 pour 14 individus.

1. Sur 1 cm2 de peau peut contenir plusieurs centaines de milliers de bactéries

2. À chaque respiration, 1 500 à 14 000 cellules microbiennes ou plus sont absorbées.

3. Dans 1 ml de salive - jusqu'à 100 millions de bactéries

4. La biomasse totale de micro-organismes dans le gros intestin est d'environ 1,5 kg.

Types de microflore du corps

Microflore résidente - permanente, autochtone, autochtone

Transitoire - non permanent, allochtone

La résistance à la colonisation est la microflore normale, empêche la colonisation des biotopes du corps par des étrangers, y compris microorganismes pathogènes.

Digestion et détoxification de substrats et de métabolites exogènes

Synthèse de vitamines, acides aminés, protéines

Participation à l'échange d'acides biliaires, d'acide urique, de lipides, de glucides, de stéroïdes

Le rôle négatif de la microflore

Les représentants pathogènes de la microflore normale peuvent être une source d’infection endogène. Normalement, ces micro-organismes ne causent pas de problèmes et, en cas d'affaiblissement du système immunitaire, tel que stafilakok, peuvent provoquer une infection purulente. E. coli - dans l'intestin, et s'il se produit dans la vessie - cystite, et s'il pénètre dans la plaie - infection purulente.

Sous l'influence de la microflore, la sécrétion d'histamine peut augmenter - conditions allergiques

Normoflora est une source de stockage et de source de plasmides de résistance aux antimicrobiens.

Les principaux biotopes du corps -

Habitats habités - dans ces biotopes, les bactéries vivent, se multiplient et remplissent certaines fonctions.

Biotopes stériles - les bactéries sont normalement absentes dans ces biotopes, leur isolement a une valeur diagnostique.

Organes génitaux externes, urètre

Conduit auditif externe

Biotopes stériles - sang, liquide céphalo-rachidien, lymphe, liquide péritonéal, liquide pleural, urine dans les reins, uretères et vessie, liquide synovial.

Microflore cutanée - staphylocoques épidermiques et saprophytes., Champignons ressemblant à des levures, diphtéroïdes, microcoques.

La microflore des voies respiratoires supérieures - streptocoques, dipteroids, Neisseria, Staphylococcus.

Cavité buccale - staphylocoques, streptocoques, champignons ressemblant à des levures, lacto-bactéries, bactéroïdes, neisserii, spirochètes, etc.

Oesophage - ne contient normalement pas de micro-organismes.

Dans l'estomac - environnement de l'habitat - extrêmement désagréable - lactobacilles, levures, staphylocoques simples et streptocoques

Intestins - la concentration en microorganismes, leur composition en espèces et leur rapport varient en fonction de la section intestinale.

Chez les personnes en bonne santé dans le duodénum, ​​le nombre de bactéries ne dépasse pas 10 à 4 à 10 à 5 unités formant colonie (c.) Par ml.

Composition en espèces - lactobacilles, bifidobactéries, bactéroïdes, enétrocoques, champignons ressemblant à des levures, etc. Avec la prise alimentaire, le nombre de bactéries peut augmenter de manière significative, mais très rapidement, il revient à son niveau initial.

Dans le haut de l'intestin grêle, le nombre de micro-organismes est de 10 à 4 à 10 à 5 unités colonisatrices par ml, dans l'iléon du 10 au 8e degré.

Mécanismes empêchant la croissance microbienne dans l'intestin grêle.

Action antibactérienne de la bile

Slime contenant des inhibiteurs de la croissance microbienne

En cas de violation de ces mécanismes, l’ensemencement microbien de l’intestin grêle augmente, c’est-à-dire excès de croissance bactérienne dans l'intestin grêle.

Dans le gros intestin chez une personne en bonne santé, le nombre de micro-organismes est de 10 à 11 - 10 à 12 ko.e par an, avec une prédominance d'espèces de bactéries anaérobies - 90 à 95% de la composition totale. Ce sont les bifidobactéries, les bactéroïdes, les lacto-bactéries, les veylonelles, les peptostreptokokki, les clostridies.

Environ 5-10% - anaérobies et aérobies facultatifs - E. coli, entérobactéries négatives au lactose, entérocoques, staphylocoques, champignons ressemblant à des levures.

Types de microflore intestinale

Pristenochnaya - constante dans sa composition, remplit la fonction de résistance à la colonisation

Illumination - composition moins constante, remplit des fonctions enzymatiques et immunisantes.

Les bifidobactries sont les représentants les plus importants des bactéries obligatoires (obligatoires) dans l'intestin. Ce sont des anaérobies, ne forment pas de spores, sont des bâtons Gram positif, les extrémités sont bifurquées et peuvent avoir des gonflements sphériques. La plupart des bifidobactéries sont situées dans le côlon, constituant sa paroi principale et sa microflore luminale. La teneur en bifidobactéries chez l’adulte est de 10 sur 9 - 10 sur 10. sur la ville

Les lactobacilles sont un autre représentant de la microflore obligatoire du tractus gastro-intestinal et sont des lactobacilles. Ce sont des bâtonnets à Gram positif, à polymorphisme prononcé, disposés en chaînes ou un par un, ne forment pas une spore. La lactoflore peut être trouvée dans le lait des humains et des animaux. Lactobacilles (lactobacilles). Le contenu dans les deux points est 10 dans le 6ème - 10 dans le 8ème kil. sur la ville

La microflore intestinale obligatoire est l'escherichia (Escherichia collie) - E. coli. Le contenu des bâtons intestinaux est 10 dans le 7ème - 10 dans le 8ème degré d'une co sur la ville

Eobioz - microflore - flore normale. L'équilibre biologique de la flore normale est facilement perturbé par des facteurs de nature exogènes et endogènes.

Dysbactériose - modification de la composition qualitative et quantitative de la microflore ainsi que de ses habitats normaux.

La dysbactériose intestinale est un syndrome clinique et de laboratoire associé à des modifications de la composition qualitative et / ou quantitative de la microflore intestinale, avec formation ultérieure de troubles métaboliques et immunologiques et, éventuellement, de troubles gastro-intestinaux.

Date d'ajout: 2016-01-30; Vues: 463; ECRITURE DE TRAVAIL

Microflore du corps humain (microflore auto)

Microflore du corps humain (microflore auto)

- il s'agit d'un agrégat de micro-organismes, de tous les biocénoses et de biotopes individuels du corps, établi au cours de l'évolution qualitative et quantitative et relativement constant.

L’enfant est né stérile mais, malgré son passage dans le canal génital, il capture la microflore qui l’accompagne. La formation de la microflore résulte du contact du nouveau-né avec les micro-organismes présents dans l’environnement et de la microflore du corps de la mère. À l'âge de 1 à 3 mois, la microflore de l'enfant devient semblable à celle d'un adulte.

Le nombre de microorganismes d'un adulte est de 10 pour 14 individus.

1. Sur 1 cm2 de peau peut contenir plusieurs centaines de milliers de bactéries

2. À chaque respiration, 1 500 à 14 000 cellules microbiennes ou plus sont absorbées.

3. Dans 1 ml de salive - jusqu'à 100 millions de bactéries

4. La biomasse totale de micro-organismes dans le gros intestin est d'environ 1,5 kg.

Types de microflore du corps

  1. Microflore résidente - permanente, autochtone, autochtone
  2. Transitoire - non permanent, allochtone

Fonction de la microflore

  1. La résistance à la colonisation est la microflore normale, empêche la colonisation des biotopes du corps par des étrangers, y compris microorganismes pathogènes.
  2. Digestion et détoxification de substrats et de métabolites exogènes
  3. Immunisation du corps
  4. Synthèse de vitamines, acides aminés, protéines
  5. Participation à l'échange d'acides biliaires, d'acide urique, de lipides, de glucides, de stéroïdes
  6. Effet anticancérogène

Le rôle négatif de la microflore

  1. Les représentants pathogènes de la microflore normale peuvent être une source d’infection endogène. Normalement, ces micro-organismes ne causent pas de problèmes et, en cas d'affaiblissement du système immunitaire, tel que stafilakok, peuvent provoquer une infection purulente. E. coli - dans l'intestin, et s'il se produit dans la vessie - cystite, et s'il pénètre dans la plaie - infection purulente.
  1. Sous l'influence de la microflore, la sécrétion d'histamine peut augmenter - conditions allergiques
  1. Normoflora est une source de stockage et de source de plasmides de résistance aux antimicrobiens.

Les principaux biotopes du corps -

  1. Habitats habités - dans ces biotopes, les bactéries vivent, se multiplient et remplissent certaines fonctions.
  2. Biotopes stériles - les bactéries sont normalement absentes dans ces biotopes, leur isolement a une valeur diagnostique.

Biotopes habités -

  1. Peau
  2. Voies aériennes
  3. GIT
  4. Organes génitaux externes, urètre
  5. Conduit auditif externe
  6. Conjonctive

Biotopes stériles - sang, liquide céphalo-rachidien, lymphe, liquide péritonéal, liquide pleural, urine dans les reins, uretères et vessie, liquide synovial.

Microflore cutanée - staphylocoques épidermiques et saprophytes., Champignons ressemblant à des levures, diphtéroïdes, microcoques.

La microflore des voies respiratoires supérieures - streptocoques, dipteroids, Neisseria, Staphylococcus.

Cavité buccale - staphylocoques, streptocoques, champignons ressemblant à des levures, lacto-bactéries, bactéroïdes, neisserii, spirochètes, etc.

Oesophage - ne contient normalement pas de micro-organismes.

Dans l'estomac - environnement de l'habitat - extrêmement désagréable - lactobacilles, levures, staphylocoques simples et streptocoques

Intestins - la concentration en microorganismes, leur composition en espèces et leur rapport varient en fonction de la section intestinale.

Chez les personnes en bonne santé dans le duodénum, ​​le nombre de bactéries ne dépasse pas 10 à 4 à 10 à 5 unités formant colonie (c.) Par ml.

Composition en espèces - lactobacilles, bifidobactéries, bactéroïdes, enétrocoques, champignons ressemblant à des levures, etc. Avec la prise alimentaire, le nombre de bactéries peut augmenter de manière significative, mais très rapidement, il revient à son niveau initial.

Dans le haut de l'intestin grêle, le nombre de micro-organismes est de 10 à 4 à 10 à 5 unités colonisatrices par ml, dans l'iléon du 10 au 8e degré.

Mécanismes empêchant la croissance microbienne dans l'intestin grêle.

  1. Action antibactérienne de la bile
  2. Perelstaltika intestinale
  3. Isolement des immunoglobulines
  4. Activité enzymatique
  5. Slime contenant des inhibiteurs de la croissance microbienne

En cas de violation de ces mécanismes, l’ensemencement microbien de l’intestin grêle augmente, c’est-à-dire excès de croissance bactérienne dans l'intestin grêle.

Dans le gros intestin chez une personne en bonne santé, le nombre de micro-organismes est de 10 à 11 - 10 à 12 ko.e par an, avec une prédominance d'espèces de bactéries anaérobies - 90 à 95% de la composition totale. Ce sont les bifidobactéries, les bactéroïdes, les lacto-bactéries, les veylonelles, les peptostreptokokki, les clostridies.

Environ 5-10% - anaérobies et aérobies facultatifs - E. coli, entérobactéries négatives au lactose, entérocoques, staphylocoques, champignons ressemblant à des levures.

Types de microflore intestinale

  1. Pristenochnaya - constante dans sa composition, remplit la fonction de résistance à la colonisation
  2. Illumination - composition moins constante, remplit des fonctions enzymatiques et immunisantes.

Les bifidobactries sont les représentants les plus importants des bactéries obligatoires (obligatoires) dans l'intestin. Ce sont des anaérobies, ne forment pas de spores, sont des bâtons Gram positif, les extrémités sont bifurquées et peuvent avoir des gonflements sphériques. La plupart des bifidobactéries sont situées dans le côlon, constituant sa paroi principale et sa microflore luminale. La teneur en bifidobactéries chez l’adulte est de 10 sur 9 - 10 sur 10. sur la ville

Les lactobacilles sont un autre représentant de la microflore obligatoire du tractus gastro-intestinal et sont des lactobacilles. Ce sont des bâtonnets à Gram positif, à polymorphisme prononcé, disposés en chaînes ou un par un, ne forment pas une spore. La lactoflore peut être trouvée dans le lait des humains et des animaux. Lactobacilles (lactobacilles). Le contenu dans les deux points est 10 dans le 6ème - 10 dans le 8ème kil. sur la ville

La microflore intestinale obligatoire est l'escherichia (Escherichia collie) - E. coli. Le contenu des bâtons intestinaux est 10 dans le 7ème - 10 dans le 8ème degré d'une co sur la ville

Eobioz - microflore - flore normale. L'équilibre biologique de la flore normale est facilement perturbé par des facteurs de nature exogènes et endogènes.

Dysbactériose - modification de la composition qualitative et quantitative de la microflore ainsi que de ses habitats normaux.

La dysbactériose intestinale est un syndrome clinique et de laboratoire associé à des modifications de la composition qualitative et / ou quantitative de la microflore intestinale, avec formation ultérieure de troubles métaboliques et immunologiques et, éventuellement, de troubles gastro-intestinaux.

Facteurs contribuant au développement de la dysbiose intestinale

  1. Maladie du tube digestif
  2. Le jeûne
  3. Chimiothérapie antimicrobienne
  4. Le stress
  5. Maladies allergiques et auto-immunes
  6. Radiothérapie
  7. Exposition aux rayonnements ionisants

Les manifestations cliniques les plus typiques

  1. Violation de la chaise - diarrhée, constipation
  2. Douleur abdominale, météorisme, ballonnements
  3. Nausées et vomissements
  4. Les symptômes communs - fatigue, faiblesse, maux de tête, troubles du sommeil, hypovitaminose peuvent survenir.

Selon le degré de compensation émise -

  1. Dysbiose compensée - les manifestations cliniques sont absentes, mais lorsque l'examen bactériologique sont des violations.
  2. Dysbactériose sous-compensée - applications graphiques mineures et modérées.
  3. Décompensé - lorsque les manifestations cliniques sont les plus prononcées.

Classification par espèce ou groupe d'organismes

  1. Un excès de staphylocoques - dysbactériose à staphylocoques
  2. Dysbactériose, causée par des entérobactéries sous condition pathogène, des champignons ressemblant à des levures, l'association de microorganismes sous condition pathogène, etc.

Dysbactériose - le concept de syndrome bactériologique, clinique et de laboratoire, ce n'est pas une maladie. La dysbactériose a une cause primaire.

Diagnostic des troubles de la microflore

  1. Diagnostic clinique et de laboratoire et identification des causes de la violation
  2. Diagnostic microbiologique avec détermination du type et du degré de désordres qualitatifs et quantitatifs de la composition de la microflore.
  3. L'étude du statut immunitaire.

Diagnostic microbiologique. Violation de la microflore du corps.

Stade préliminaire - examen microscopique des matières fécales - frottis et peint au gramme

Recherche bactériologique ou culturelle. Cette méthode est utilisée depuis de nombreuses années. Une partie des matières fécales en suspension dans une solution tampon. Préparer une dilution de 10 à -1 à 10 degrés. Effectuer le semis sur un milieu nutritif. Identifier les micro-organismes cultivés par leurs propriétés culturelles, morphologiques, tinctoriales, biochimiques et autres, et calculer des indicateurs de microflore, UFC / g de fèces.

Milieu nutritif -

Mercredi Blaurokka - pour l'isolement de bifidobactéries

Gélose MPC pour les bactéries lacto

Mercredi Endo, Ploskireva, Levin - pour l’isolement de E. coli et d’entérobactéries opportunistes.

Wednesday Wilson - Blair - anaérobies sporulées - Clostridium

Wednesday Saburo - champignons ressemblant à la levure - genre Candida

Blood MPA - microorganismes hémolytiques

Les principes de correction des troubles de la composition de la microflore sont non spécifiques - régime, régime alimentaire, décontamination des biotopes de l'organisme, à partir de micro-organismes pathogènes et conditionnellement pathogènes.

Probiotiques et Prébiotiques

- correction des troubles de l'immunité.

Les probiotiques et les eubiotiques sont des médicaments qui incluent des micro-organismes vivants qui ont un effet normalisant sur la composition et l'activité biologique de la microflore du tube digestif.

Conditions requises pour les probiotiques.

  1. Conformité à la microflore humaine normale
  2. Haute viabilité et activité biologique
  3. Antagonisme contre la microflore pathogène et conditionnellement pathogène
  4. Résistance aux facteurs physiques et chimiques
  5. Résistance aux antibiotiques
  6. Présence de souches symbiotiques dans l'appareil

Classification des probiotiques

  1. Monocomposant classique - bifidumbactérine, colibactérine, lactobactérine
  2. Polycomponent - bifikol, atsilakt, lineks
  3. Antagonistes auto-éliminants - baktisubtil, sporobactérine, eubicor, entérol
  4. Combiné - biforme
  5. Probiotiques contenant des souches recombinantes
  6. Prébiotiques - hilak forte, lactulose, galacto et fructooligosaccharides
  7. Synbiotics - Acipol, Normoflorin

Les prébiotiques sont des préparations qui créent des conditions favorables à l’existence d’une microflore normale.

Les synbiotiques sont des médicaments contenant une combinaison rationnelle de probiotiques et de prébiotiques.

Préparations de bactériophages - spécificité d'action sur certains microorganismes.

Microbiote pariétal et de la cavité abdominale dans le syndrome du côlon irritable

L'article traite des concepts de la microflore normale du tube digestif et de ses fonctions, des caractéristiques de la cavité et du microbiote pariétal, et définit le syndrome du côlon irritable (SCI) et ses formes cliniques. Les résultats de l'étude de la microflore rectale du rectum par la méthode de la réaction en chaîne de la polymérase chez des individus en bonne santé et des patients atteints de SCI ont été présentés. Différences statistiquement significatives identifiées. Une analyse comparative de la composition de la microflore de la muqueuse rectale et des fèces chez les patients atteints de SCI avec constipation et diarrhée est présentée.

Les études sur la composition de la microbiocénose du tractus gastro-intestinal (GIT) d'une personne ont commencé il y a plus de trois siècles, quand, en 1681, le chercheur néerlandais Anthony Van Leeuwenhoek rapporta pour la première fois ses observations sur les bactéries et autres micro-organismes trouvés dans les selles types de bactéries dans le tube digestif. Actuellement, la microflore intestinale, son impact sur la santé et la maladie de l'homme, suscitent un regain d'intérêt généralisé. Le développement de nouvelles technologies de génétique moléculaire permettant d'identifier de nombreux types de bactéries non cultivables, a été un facteur déclenchant pour une étude approfondie du microbiote humain. De nouveaux faits sont apparus indiquant que la biocénose intestinale est associée à des maladies non seulement du tractus gastro-intestinal, mais également du système cardiovasculaire, de l'obésité, des maladies allergiques et auto-immunes [1].

Pour étudier l’état de la microbiocénose et identifier les éventuels écarts par rapport à la composition normale de la microflore du tube digestif, nous avons défini le concept de microflore normale. La microflore normale est un rapport qualitatif et quantitatif dans des organes et systèmes individuels de diverses populations de microbes qui maintiennent l'équilibre biochimique, métabolique et immunitaire du macroorganisme, nécessaire au maintien de la santé humaine [2]. Pour faire référence à la microflore normale des organismes supérieurs, T. Rosebury, dans sa monographie «Microorganisms Indigenous to Man», publiée dès 1962 à New York, a proposé le nom de «microbiote», qui est le plus souvent utilisé dans la littérature moderne. Décrivant le microbiote, le terme «biotope» est souvent utilisé. Le biotope est généralement compris comme une partie de la membrane muqueuse, de la peau ou de l’organe d’un macroorganisme ayant le même type de microorganisme [3]. Du point de vue moderne, une microflore humaine normale est considérée comme un système phylogénétique de microbiocénoses multiples caractérisé par une composition spécifique et occupant un biotope particulier dans le corps humain [4]. La masse totale de tous les micro-organismes colonisant les organes et tissus humains est de 3 à 5 kg.

La microflore du tractus gastro-intestinal est la plus représentative, sa masse chez l’adulte est supérieure à 2,5 kg, le nombre - 1014 UFC [5]. Compte tenu des nouvelles données obtenues lors de l'étude de la microflore de divers biotopes du tractus gastro-intestinal à l'aide de méthodes de génétique moléculaire, le génome total de la bactérie du tractus gastro-intestinal contient 600 000 gènes, soit 24 fois la taille du génome humain. La plupart des nouveaux phylotypes de micro-organismes proposés sont des représentants des genres Firmicutes et Bacteroides. Le nombre total d'espèces approche les 1500 et nécessite des éclaircissements [6].

La cavité du tractus gastro-intestinal à travers le système sphincter communique avec l'environnement externe du monde qui nous entoure et, en même temps, à travers la paroi intestinale avec l'environnement interne du corps. Grâce à cette caractéristique, un environnement intrinsèque a été créé dans le tractus gastro-intestinal, qui peut être divisé en deux niches distinctes: le chyme et la muqueuse. Sur le plan microécologique, le biotope gastro-intestinal peut être divisé en palangres (cavité buccale, estomac, coupes intestinales) et microbiotopes (abdominaux et pariétaux).

Le microbiote de la cavité dans tout le tractus gastro-intestinal est hétérogène, ses propriétés sont déterminées par la composition et la qualité du contenu de l'un ou l'autre niveau. Les palangres ont leurs propres caractéristiques anatomiques et fonctionnelles. Ainsi, leur contenu varie en composition, consistance, pH, vitesse de déplacement et autres propriétés. Ces propriétés déterminent la composition qualitative et quantitative des cavités microbiennes qui leur sont adaptées. La microflore abdominale est plus variable que la muqueuse et sensible à diverses influences exogènes.

À cet égard, pour la formation de paramètres quantitatifs et qualitatifs optimaux de la microflore abdominale, la fourniture de fibres alimentaires non digestibles, qui jouent à la fois le rôle de substrat et de matrice nutritifs, sur laquelle des représentants de la microflore obligatoire sont fixés et forment des colonies, revêt une grande importance.

Le microbiote pariétal est la structure la plus importante, limitant l'environnement interne du corps de l'extérieur. Il est représenté par les recouvrements muqueux (gel muqueux, gel de mucine), le glycocalyx situé au-dessus de la membrane apicale des entérocytes (colonocytes) et la surface de la membrane apicale elle-même. La microflore pariétale de l'intestin colonise la membrane muqueuse sous forme de microcolonies, formant un film biologique particulier constitué de corps microbiens et d'une matrice d'exopolysaccharide. Les exopolysaccharides de micro-organismes (glycocalyx) protègent les cellules microbiennes de toute une gamme d'effets physico-chimiques et biologiques. La muqueuse intestinale est également protégée par un film biologique. Il existe une relation étroite entre les colonies de micro-organismes et la paroi intestinale, ce qui leur permet d'être combinées dans un complexe microbien-tissu [7]. Le microbiotope pariétal présente un intérêt majeur du point de vue de la bactériologie, car c’est là que se produit l’interaction avec les bactéries bénéfique ou néfaste pour l’être humain - ce que nous appelons la symbiose. La microflore abdominale et pariétale sont deux populations interconnectées, entre lesquelles il existe un échange constant de micro-organismes, entraînant la formation d'un variant individuel de la microflore intestinale normale.

Il existe une relation étroite entre la microflore eubiotique intestinale et les fonctions principales du tractus gastro-intestinal: la microflore eubiotique intestinale affecte les fonctions du tractus gastro-intestinal, qui à son tour affecte l'eubiosis. Dans cette relation, l'intégrité structurale et fonctionnelle de la membrane muqueuse est maintenue. activité motrice, assurant le mouvement du substrat le long du tractus gastro-intestinal; transformation de polymères alimentaires par lipolyse et hydrolyse; transport des nutriments à travers une couche de couches de mucus; régulation du processus digestif à l'aide de mécanismes de substrat et neuroendocriniens; protection du corps contre l'agression d'antigènes étrangers; maintenir l’eubiose et les constantes qualitatives et quantitatives de l’équilibre démographique de la microbiocénose intestinale [8].

L'une des maladies qui, comme le prouvent de nombreuses études récentes, est accompagnée de modifications de la microbiocénose du GIT est le syndrome du côlon irritable (SCI). Selon le Consensus III de Roman sur les troubles digestifs fonctionnels, le SCI est une maladie intestinale fonctionnelle caractérisée par des douleurs abdominales ou une gêne abdominale associée à la défécation, à des modifications de la fréquence et de la nature des selles. En fonction des symptômes, le SCI se divise en trois formes: à prédominance de la diarrhée, à prédominance de la constipation, et mixte, caractérisée par l'alternance constipation et diarrhée [9]. La capacité de la microflore intestinale à produire des neurotransmetteurs qui affectent le système entérique et modifient ainsi la sécrétion et la motilité de l'intestin, ainsi que le seuil de sensibilité viscérale, indique l'importance des modifications dysbiotiques de la pathogenèse de la CPK [10, 11].

On sait que la composition de la microflore des matières fécales diffère de celle de la muqueuse intestinale. Mais quelle est la nature de ces différences et si la forme clinique de la maladie, caractéristique du dysfonctionnement moteur intestinal, est inconnue. Au vu de ce qui précède, il nous a paru pertinent et intéressant d’étudier la composition de la microflore pariétale du rectum d’individus en bonne santé et de patients atteints du SII; procéder à une évaluation comparative de la composition de la microflore de la cavité et du microbiote pariétal du rectum de patients atteints du SCI, en utilisant une réaction en chaîne par polymérase en temps réel (PCR-RV).

Matériel et méthodes

Pour résoudre les problèmes, 40 patients atteints de SCI ont été sélectionnés: 20 patients avec une prédominance de diarrhée (SCI-D) ont été diagnostiqués, et 20 patients avec une SCI présentant une prévalence de constipation (SCI-W). Le diagnostic de la maladie était basé sur les critères de diagnostic développés par le Consensus Romain III sur les troubles digestifs fonctionnels. Les hommes représentaient 62,5%, l'âge moyen des patients était de 39,6 ± 8,0 ans. Le groupe témoin (GC) était composé de 14 volontaires en bonne santé et de nutrition normale, âgés de 19 à 50 ans (11 hommes et 3 femmes). Une condition obligatoire pour l'inclusion dans le groupe de sujets était le consentement écrit de chaque patient et d'un sujet en bonne santé. Des échantillons d'échantillons de biopsie de la muqueuse rectale ont été collectés chez des individus en bonne santé et des patients sélectionnés présentant une fibrosigmoscopie. Des échantillons fécaux ont été collectés chez des patients, qui ont été congelés pour une analyse moléculaire ultérieure par PCR-RV.

Le diagnostic PCR des échantillons à l'étude a été réalisé à l'aide de l'amplificateur DT96 (NPO DNA-Tekhnologiya, Russie), qui garantissait les performances de la PCR avec enregistrement automatique des résultats en mode «temps réel». Le kit de réactifs comprenait un mélange pour l’amplification PCR spécifique de toutes les bactéries (masse bactérienne totale), des mélanges spécifiques pour les microorganismes détectés. Un échantillon de contrôle interne a été ajouté à l'un des tubes avec le mélange d'amplification pour évaluer l'efficacité de la PCR. L'un des tubes contenait un mélange pour l'amplification de l'ADN génomique humain, conçu pour évaluer le contrôle de la prise de matériel clinique.

Dans les échantillons étudiés par la méthode PCR-RV, les indicateurs suivants ont été déterminés: contrôle de la capture de matière (CME), masse bactérienne totale (MBP), valeurs absolues des microorganismes, avec calcul ultérieur des indicateurs relatifs. Les valeurs absolues de MBP, de CME et de microorganismes diagnostiqués dans les résultats de PCR-RV ont été présentées sous la forme d'un logarithme décimal (lg), calculé par le nombre de cycles à seuil, et correspondaient approximativement à la quantité d'ADN souhaitée exprimée dans le génome équivalent dans l'échantillon (GE / obr). Pour une analyse plus objective, les indicateurs quantitatifs relatifs calculés du microbiote reflètent le nombre de micro-organismes spécifiques par rapport à la masse bactérienne totale. Les indicateurs relatifs ont été présentés sous forme de différence entre les logarithmes décimaux du groupe de microorganismes correspondant et la masse bactérienne totale.

Dans les échantillons, 27 groupes de bactéries des quatre principaux phylotypes (Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria, Actinobacteria) ont été identifiés (Tableau 1).

Le traitement des données statistiques a été effectué sur un ordinateur personnel à l'aide de programmes informatiques sous licence Microsoft Excel 2007 et SPSS-Statistics 17. Lors de l'analyse de la distribution des données quantitatives, les mesures de tendance centrales - la médiane (Me) - sont déterminées et les mesures de dispersion - la plage interquartile sous forme de percentiles de 25 et 75%. Le test non paramétrique de Mann-Whitney a été utilisé pour calculer la signification des différences dans de petits échantillons. Le critère de signification statistique était le niveau p ≤ 0,05.

Résultats de recherche et discussion

Au cours de la première étape du travail, une analyse comparative de la microflore de la muqueuse rectale de volontaires sains et de patients atteints de SCI-D et de SCI-W a été réalisée. Tout d'abord, il convient de souligner l'augmentation de la contamination bactérienne totale de la muqueuse rectale dans les deux formes cliniques du SCI. Les différences de CPK-3 - MBP - 6,0 (5,6; 6,5) lg GE / arr étaient statistiquement significatives. en comparaison avec le groupe de contrôle - MBP - 5.2 (4.0, 5.6) log GE / arr. (p = 0,002).

Dans le SCI, quelle que soit la forme clinique, une teneur élevée en Faecalibacterium praustnizi a été trouvée dans la microflore muqueuse du rectum par rapport au GC: avec le SCI-G (p = 0,047), le SCI-D (p = 0,05). Chez les patients atteints du SCI-D comparés à la GK, la concentration d'Eubacterium spp était inférieure. (p = 0,049) (Fig. 1).

Pour établir la relation entre la fréquence maximale par jour des selles avec IBS-D et la concentration d'eubactéries dans la muqueuse rectale, une analyse de corrélation de ces indicateurs a été réalisée. Il a été établi que le nombre maximal de selles par jour est en corrélation négative avec la concentration d’eubactéries dans la muqueuse rectale (-0,47; p